ปลาทองหัวสิงห์จำปามีลำตัวเป็นสีเหลืองทองคล้ายสีของดอกจำปา ซึ่งปลาทองหัวสิงห์สายพันธุ์นี้เข้าใจว่าเป็นปลาที่ได้จากการผสมพันธุ์ระหว่างปลาทองหัวสิงห์ที่มีสีดำ กับปลาทองหัวสิงห์ที่มีสีทอง ซึ่งลูกปลาที่เพาะออกมาได้นั้นโดยมากจะมีสีออกสีเหลืองทอง แต่ก็มีบางตัวที่มีสีเป็นกระดำกระด่าง